约翰霍普金斯大学的生物医学工程专业在US News排名中位居榜首，学校的生物医学工程系成立于1962年，开设在工程学院下(Whiting School of Engineering)。50年间，该系的学生和教师们不断在生物医学研究领域突破创新。该系拥有初级教授40人，研究教授14人，第二级别教授54人。教师队伍中都是各自的研究领域的领军人物，研究从细胞结构的理论模型到工程化的人类组织培养和植入。
目前，有450多名本科生和250多名研究生就读于霍普金斯大学生物医学工程系，为自己在医学，基础科学和产业的职业生涯做准备。该部门的新开设的生物设计工作室(Biomedical Design Studio)为学生提供了首个能够集思广益，设计和开发原型来解决临床和健康问题的工作空间和资源。另外，已经有22家创立公司的商业化技术来源于生物医学工程系内部教师的研究以及学生项目。
生物医学工程系的使命是通过卓越的研究和工程，生物，医学交叉领域的教育来改善人类健康。学生从大一开始就有机会与教员密切合作，领域涉及医疗成像、计算生物学,生物信息学,成像科学、生物材料、细胞和组织工程和微系统。由于约翰霍普金斯大学拥有顶尖的医学院，这为生物医学工程的研究提供了极大的便利。因此学生还能够参与顶级医学院的研究，有机会成为设计团队中的一员，从概念到原型参与目前亟须的疗法和设备的设计制作过程中。
约翰霍普金斯大学生物医学工程专业研究领域：
生物信息学和计算生物学Bioinformatics and Computational Biology
心血管系统Cardiovascular Systems
细胞与组织工程Cell and Tissue Engineering
计算模型Computational Modeling
医学影像Medical Imaging
分子和细胞系统Molecular and Cell Systems
神经系统Systems Neuroscience
约翰霍普金斯大学生物医学工程专业开设的学位项目：
本科阶段：
BS in Biomedical Engineering
约翰霍普金斯大学生物医学工程本科项目由怀挺工程学院(Whiting School of Engineering)和医学院(Johns Hopkins School of Medicine)联合开设,被广泛认为是世界上最好的生物医学工程培训项目之一。
生物医学工程理学学士项目(BS in Biomedical Engineering)为学生提供数学，工程，科学和人文科学和社会科学的坚实基础。该学位项目获得了ABET认证。本科学生在完成项目所要求核心课程之后可以选择以下四个领域的高级工程课程：包括：
*系统生物学，了解生物系统是如何运作的
*传感器，微系统/纳米系统和仪器，建立新设备来促进研究和临床医学
*细胞/组织工程与生物材料，创建替代细胞，组织和器官的材料和组织
*计算生物工程，运用数学理论和计算机来解决复杂的生物学和医学问题
*成像，开发新的成像技术揭示生物系统如何工作，进一步诊断疾病
BA in Biomedical Engineering
生物医学工程文学学士项目(BA in Biomedical Engineering)相比理学学士项目而言，要求的工程相关课程更少，因此留下更多选修课程的空间，这使得该项目相比BS来说课程设置更灵活，更加多样化。适合那些想要一些工程背景，但是希望今后能够攻读研究生学位项目，不再从事工程方面工作的学生。
研究生生阶段：
MSE. in Biomedical Engineering
硕士学位项目培养学生未来在研究方向发展事业，或作为博士学位项目，以及M.D. / Ph.D.项目教育的其中一环。每个学生至少需要修24学分的课程，课程级别在400级或更高，并要完成一篇论文。申请时，需要学生有工程学学士学位背景。基础科学本科背景的学生也可以考虑，但需要多修一些相关课程。申请者要均衡完成大学水平的物理，化学，数学，生物学课程。
Master of Science Bioengineering Innovation & Design
该项目设立在约翰霍普金斯大学的生物工程创新设计中心( Center for Bioengineering Innovation and Design ，CBID)。中心为学生提供机会设计，开发，建设，测试生物医学仪器设备。
生物工程创新与设计硕士项目是一个严谨的，医学创新和生物设计项目，旨在培养下一代的医疗创新者。该项目不同于其他任何项目，它包括在约翰霍普金斯医院的临床轮换实习(clinical rotations)，在霍普金斯大学附属的JHPIEGO培训，最后有机会与临床，学术和行业顾问的指导下进行原型设计与测试。CBID为期一年的非研究性硕士项目核心在于集中的实操的工程设备设计体验，为学生提供机会与医学院医生密切合作，找出问题，再设计和建造的产品来解决问题。项目将授予科学工程硕士学位，许多学生毕业时都通过他们的项目获得了专利。
PhD
PhD项目原意是要招收工程领域最优秀的学生，让他们同医科学生一起学习生物科学核心知识，再培养他们的高等数学和工程科学知识。学院培养学生在生命科学和现代工程，数学和计算机科学方面的训练和原创性研究。研究领域包括：计算生物学(Computational Biology)，医学影像(Medical Imaging)，分子神经心血管系统(Molecular Neural Cardiovascular Systems (MNCS))，神经科学和神经工程(Neuroscience and Neuroengineering)。
